1、可以提高肥效如過磷酸鈣、微量元素等肥料，施入土壤后被土壤固定而失效。和有機肥混合用，由于減少了與土壤的接觸面，減少了養(yǎng)分的固定，有機肥又可提高磷礦石的溶解度，在水田條件下更好。許多化肥與有機肥混合后，化肥可以被有機肥料吸收保蓄，減少流失。此外，化肥摻有機肥料還可以促進有機肥腐熟，提高肥效。試驗表明，化肥與有機肥搭配使用，既可以降低土壤氧化還原電位，減少氨的硝化，也可以減少氮素的揮發(fā)損失。一般可使氮肥利用率提高10%～15%。
2、可以減少化肥可能產生的某些不利的副作用在單獨施用較大量化肥或化肥施用不均時，土壤溶液濃度高，影響作物吸水，甚至傷根，如與有機肥料混合就不會發(fā)生這一問題。另外，如長期單獨施用生理酸性肥料，會使土壤變酸，而產生過多的活性鐵、活性鋁等有害物質，對作物造成毒害。而同有機肥料混合施用，可以增加土壤的緩沖性能，防止土壤酸化。再如，有的過磷酸鈣含游離酸過多，做種肥時會影響種子發(fā)芽和幼苗生長，加入有機肥料后，中和游離酸，可減少對種子的為害。
3、可以增加作物營養(yǎng)有機肥所含養(yǎng)分較全，肥效穩(wěn)而長，含有機質多，能提高土壤有機質含量，改善土壤理化性質。不但可以供給作物，而且可以供給土壤微生物以氮、磷、鉀等養(yǎng)分，以及維生素和生長激素等。有機肥施入后，土壤酶活性增強，有利于養(yǎng)分轉化。如有機肥與過磷酸鈣或過磷酸鎂肥等混合，可以促進土壤中自生固氮菌的生長，增加作物氮素營養(yǎng)。據(jù)試驗，化肥與有機肥搭配使用3年的地塊比單施化肥的地塊有機質含量高0.08%～0.11%，氨化細菌增加260%，好氣性固氮菌增加 119%，纖維分解菌增加600%。
4、在秸稈還田和施用未腐熟有機肥時，加入化學氮肥，可以避免作物因早期缺氮而影響生長而供應的速度要緩慢，而且禾谷類作物成熟階段需要同時提供硝態(tài)氮和銨態(tài)氮，有機肥料能夠做到這一點。
